Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr1d1Q3UV55 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms