Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl5Q3UTQ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl5Q3UTQ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms