Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem241Q3UME2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem241Q3UME2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem241Q3UME2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms