Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef1Q3UHC1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef1Q3UHC1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef1Q3UHC1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef1Q3UHC1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef1Q3UHC1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef1Q3UHC1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef1Q3UHC1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef1Q3UHC1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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