Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mcrip1Q3UGS4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms