Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rrp36Q3UFY0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp36Q3UFY0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms