Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem109Q3UBX0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem109Q3UBX0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem109Q3UBX0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms