Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf180Q3U827 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf180Q3U827 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf180Q3U827 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms