Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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