Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc17a7Q3TXX4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc17a7Q3TXX4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms