Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbxip1Q3TVI8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms