Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21440Q3TTD8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21440Q3TTD8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms