Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uri1Q3TLD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Uri1Q3TLD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uri1Q3TLD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms