Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hs1bp3Q3TC93 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hs1bp3Q3TC93 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hs1bp3Q3TC93 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms