Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jsrp1Q3MI48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jsrp1Q3MI48 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jsrp1Q3MI48 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms