Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdgfl1Q2VPR5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdgfl1Q2VPR5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms