Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
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Shroom4Q1W617 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Shroom4Q1W617 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms