Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tdrd9Q14BI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tdrd9Q14BI7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tdrd9Q14BI7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tdrd9Q14BI7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tdrd9Q14BI7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tdrd9Q14BI7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tdrd9Q14BI7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms