Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q149G0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q149G0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q149G0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q149G0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q149G0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q149G0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q149G0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q149G0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q149G0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q149G0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q149G0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q149G0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q149G0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q149G0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q149G0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q149G0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q149G0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q149G0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q149G0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q149G0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q149G0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q149G0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q149G0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q149G0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q149G0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q149G0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q149G0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms