Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim24Q0VG18 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim24Q0VG18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim24Q0VG18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms