Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd12Q0VE29 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms