Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms