Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Calb2Q08331 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb2Q08331 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms