Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LyarQ08288 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LyarQ08288 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LyarQ08288 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LyarQ08288 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LyarQ08288 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LyarQ08288 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LyarQ08288 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LyarQ08288 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LyarQ08288 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LyarQ08288 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LyarQ08288 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms