Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn2Q08093 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn2Q08093 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms