Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnn1Q08091 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms