Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn3Q07409 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cntn3Q07409 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms