Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 PRM10YJL108C 1152 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YMR178WYMR178W 825 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YOL166CYOL166C 339 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 SAM4YPL273W 978 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 TCM62YBR044C 1719 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 MEC3YLR288C 1425 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 BDP1YNL039W 1785 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 MNT2YGL257C 1677 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 PRO3YER023W 861 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 CSR1YLR380W 1227 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 RSF1YMR030W 1131 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 MTG1YMR097C 1104 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 TLG2YOL018C 1194 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 CDC21YOR074C 915 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 TRS33YOR115C 807 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 MPD1YOR288C 957 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 BBP1YPL255W 1158 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 MTC1YJL123C 1437 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 DOA1YKL213C 2148 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 TSL1YML100W 3297 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YJR026WYJR026W 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YJR028WYJR028W 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YAR010CYAR010C 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YML040WYML040W 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YMR051CYMR051C 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 ZRC1YMR243C 1329 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.45□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 APJ1YNL077W 1587 nt4.44□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 PCL8YPL219W 1479 nt4.44□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 VHC1YBR235W 3363 nt4.44□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 GON7YJL184W 372 nt4.44□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 HEK2YBL032W 1146 nt4.44□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 PRD1YCL057W 2139 nt4.44□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 SLM5YCR024C 1479 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 STP4YDL048C 1473 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 PUS9YDL036C 1389 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YHR177WYHR177W 1362 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 KAR5YMR065W 1515 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 THI5YFL058W 1023 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YGL199CYGL199C 471 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 BGL2YGR282C 942 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 TEF4YKL081W 1239 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 POM33YLL023C 840 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 ERG3YLR056W 1098 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 MIM2YLR099W-A 264 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 THI12YNL332W 1023 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 VPS68YOL129W 555 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 ZPS1YOL154W 750 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 SPS4YOR313C 1017 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YPL191CYPL191C 1083 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 ATG14YBR128C 1035 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 SRB6YBR253W 366 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 SFI1YLL003W 2841 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 PGM2YMR105C 1710 nt4.43□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 LHP1YDL051W 828 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YGR015CYGR015C 987 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YGR016WYGR016W 573 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 GAT4YIR013C 366 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 FUN19YAL034C 1242 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 LDB18YLL049W 540 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 TIS11YLR136C 858 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YLR198CYLR198C 360 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 COS3YML132W 1140 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YTA12YMR089C 2478 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 COS2YBR302C 1140 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 PEX34YCL056C 435 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 RAD16YBR114W 2373 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YDR444WYDR444W 2064 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YDL109CYDL109C 1944 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 KRS1YDR037W 1776 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 FAP1YNL023C 2898 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 KAR1YNL188W 1302 nt4.42□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 MHR1YDR296W 681 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YHR112CYHR112C 1137 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YKL023WYKL023W 834 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 SEC65YML105C 822 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 YIP3YNL044W 531 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 ATG19YOL082W 1248 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 RMI1YPL024W 726 nt4.41□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 EFM2YBR271W 1260 nt4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.2 ms