Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrstQ06666 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms