Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrx2Q06348 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrx2Q06348 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms