Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnal1Q05A62 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnal1Q05A62 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnal1Q05A62 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms