Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col6a2Q02788 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms