Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfiaQ02780 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfiaQ02780 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms