Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcqQ02111 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms