Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snai1Q02085 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snai1Q02085 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snai1Q02085 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms