Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb2Q00977 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb2Q00977 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms