Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1eQ00898 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1eQ00898 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms