Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp4Q00724 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbp4Q00724 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms