Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeleQ00690 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeleQ00690 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SeleQ00690 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms