Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabpaQ00422 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GabpaQ00422 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GabpaQ00422 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms