Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab33aP97950 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab33aP97950 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab33aP97950 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab33aP97950 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms