Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smn1P97801 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smn1P97801 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smn1P97801 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 536.8 ms