Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra1P97785 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms