Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas1P97459 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas1P97459 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms