Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp1P97350 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms