Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx1P81068 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx1P81068 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx1P81068 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx1P81068 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms