Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx3P81067 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx3P81067 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx3P81067 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx3P81067 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx3P81067 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx3P81067 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx3P81067 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms