Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx1P80205 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx1P80205 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx1P80205 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms