Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb6P70689 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms