Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chl1P70232 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Chl1P70232 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chl1P70232 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chl1P70232 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chl1P70232 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chl1P70232 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms